Protein–RNA interactions for Protein: P97812

Ihh, Indian hedgehog protein, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IhhP97812 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IhhP97812 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IhhP97812 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IhhP97812 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IhhP97812 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IhhP97812 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IhhP97812 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IhhP97812 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IhhP97812 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IhhP97812 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IhhP97812 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IhhP97812 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IhhP97812 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IhhP97812 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IhhP97812 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IhhP97812 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IhhP97812 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IhhP97812 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IhhP97812 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IhhP97812 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IhhP97812 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IhhP97812 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IhhP97812 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IhhP97812 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IhhP97812 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IhhP97812 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IhhP97812 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IhhP97812 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IhhP97812 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IhhP97812 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IhhP97812 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IhhP97812 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IhhP97812 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IhhP97812 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IhhP97812 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IhhP97812 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IhhP97812 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IhhP97812 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IhhP97812 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IhhP97812 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IhhP97812 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IhhP97812 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IhhP97812 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IhhP97812 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IhhP97812 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IhhP97812 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IhhP97812 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IhhP97812 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IhhP97812 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IhhP97812 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IhhP97812 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IhhP97812 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IhhP97812 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IhhP97812 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IhhP97812 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IhhP97812 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IhhP97812 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IhhP97812 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IhhP97812 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IhhP97812 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IhhP97812 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IhhP97812 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IhhP97812 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IhhP97812 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IhhP97812 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IhhP97812 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IhhP97812 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IhhP97812 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IhhP97812 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IhhP97812 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IhhP97812 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IhhP97812 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IhhP97812 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IhhP97812 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IhhP97812 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IhhP97812 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IhhP97812 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IhhP97812 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IhhP97812 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IhhP97812 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IhhP97812 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IhhP97812 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IhhP97812 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IhhP97812 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IhhP97812 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IhhP97812 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IhhP97812 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IhhP97812 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IhhP97812 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IhhP97812 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IhhP97812 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IhhP97812 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IhhP97812 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IhhP97812 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IhhP97812 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IhhP97812 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IhhP97812 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IhhP97812 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IhhP97812 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IhhP97812 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms