Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AlkP97793 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AlkP97793 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AlkP97793 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AlkP97793 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AlkP97793 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AlkP97793 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AlkP97793 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AlkP97793 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AlkP97793 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AlkP97793 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AlkP97793 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AlkP97793 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AlkP97793 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AlkP97793 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AlkP97793 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AlkP97793 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AlkP97793 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AlkP97793 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AlkP97793 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AlkP97793 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AlkP97793 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AlkP97793 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AlkP97793 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AlkP97793 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AlkP97793 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AlkP97793 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AlkP97793 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AlkP97793 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AlkP97793 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AlkP97793 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AlkP97793 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AlkP97793 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AlkP97793 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AlkP97793 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AlkP97793 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AlkP97793 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AlkP97793 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AlkP97793 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AlkP97793 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AlkP97793 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AlkP97793 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AlkP97793 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AlkP97793 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AlkP97793 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
AlkP97793 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AlkP97793 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AlkP97793 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AlkP97793 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AlkP97793 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AlkP97793 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AlkP97793 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AlkP97793 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AlkP97793 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AlkP97793 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AlkP97793 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AlkP97793 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AlkP97793 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
AlkP97793 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AlkP97793 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AlkP97793 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AlkP97793 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AlkP97793 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AlkP97793 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AlkP97793 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AlkP97793 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AlkP97793 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AlkP97793 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AlkP97793 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AlkP97793 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AlkP97793 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AlkP97793 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AlkP97793 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AlkP97793 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AlkP97793 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AlkP97793 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AlkP97793 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
AlkP97793 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
AlkP97793 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AlkP97793 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AlkP97793 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AlkP97793 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AlkP97793 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AlkP97793 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AlkP97793 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AlkP97793 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AlkP97793 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AlkP97793 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AlkP97793 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AlkP97793 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AlkP97793 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AlkP97793 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AlkP97793 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AlkP97793 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AlkP97793 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AlkP97793 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AlkP97793 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AlkP97793 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AlkP97793 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AlkP97793 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms