Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lig3P97386 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lig3P97386 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lig3P97386 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lig3P97386 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig3P97386 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig3P97386 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig3P97386 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms