Protein–RNA interactions for Protein: P97313

Prkdc, DNA-dependent protein kinase catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 4,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkdcP97313 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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