Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms