Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms