Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arf1P84078 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Arf1P84078 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Arf1P84078 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arf1P84078 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arf1P84078 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arf1P84078 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Arf1P84078 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arf1P84078 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arf1P84078 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arf1P84078 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms