Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf3P70671 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf3P70671 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf3P70671 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf3P70671 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf3P70671 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf3P70671 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf3P70671 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf3P70671 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf3P70671 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf3P70671 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf3P70671 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf3P70671 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf3P70671 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms