Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms