Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx3P70354 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx3P70354 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx3P70354 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx3P70354 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx3P70354 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx3P70354 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx3P70354 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx3P70354 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx3P70354 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx3P70354 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx3P70354 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms