Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cux2P70298 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cux2P70298 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cux2P70298 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cux2P70298 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cux2P70298 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cux2P70298 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cux2P70298 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cux2P70298 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cux2P70298 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms