Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UbdP63072 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UbdP63072 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UbdP63072 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UbdP63072 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UbdP63072 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UbdP63072 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UbdP63072 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UbdP63072 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UbdP63072 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UbdP63072 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UbdP63072 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UbdP63072 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UbdP63072 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UbdP63072 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UbdP63072 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UbdP63072 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UbdP63072 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UbdP63072 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UbdP63072 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UbdP63072 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
UbdP63072 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UbdP63072 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UbdP63072 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UbdP63072 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UbdP63072 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
UbdP63072 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UbdP63072 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UbdP63072 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UbdP63072 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UbdP63072 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UbdP63072 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
UbdP63072 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UbdP63072 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UbdP63072 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
UbdP63072 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
UbdP63072 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
UbdP63072 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
UbdP63072 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UbdP63072 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
UbdP63072 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UbdP63072 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
UbdP63072 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UbdP63072 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UbdP63072 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UbdP63072 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UbdP63072 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UbdP63072 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
UbdP63072 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UbdP63072 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UbdP63072 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UbdP63072 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UbdP63072 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UbdP63072 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UbdP63072 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UbdP63072 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UbdP63072 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UbdP63072 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UbdP63072 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UbdP63072 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UbdP63072 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UbdP63072 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UbdP63072 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UbdP63072 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UbdP63072 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UbdP63072 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
UbdP63072 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UbdP63072 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
UbdP63072 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
UbdP63072 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
UbdP63072 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UbdP63072 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UbdP63072 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UbdP63072 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UbdP63072 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
UbdP63072 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UbdP63072 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UbdP63072 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
UbdP63072 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UbdP63072 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UbdP63072 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
UbdP63072 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UbdP63072 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
UbdP63072 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UbdP63072 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
UbdP63072 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
UbdP63072 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UbdP63072 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UbdP63072 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UbdP63072 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UbdP63072 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
UbdP63072 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UbdP63072 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
UbdP63072 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UbdP63072 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UbdP63072 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UbdP63072 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
UbdP63072 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UbdP63072 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
UbdP63072 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms