Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga11P61622 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga11P61622 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga11P61622 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga11P61622 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms