Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms