Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SmoP56726 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SmoP56726 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SmoP56726 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SmoP56726 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SmoP56726 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SmoP56726 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SmoP56726 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SmoP56726 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SmoP56726 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SmoP56726 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SmoP56726 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SmoP56726 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SmoP56726 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SmoP56726 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SmoP56726 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SmoP56726 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SmoP56726 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SmoP56726 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SmoP56726 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SmoP56726 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SmoP56726 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SmoP56726 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SmoP56726 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SmoP56726 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SmoP56726 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SmoP56726 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SmoP56726 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SmoP56726 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SmoP56726 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SmoP56726 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SmoP56726 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SmoP56726 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SmoP56726 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SmoP56726 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SmoP56726 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SmoP56726 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SmoP56726 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SmoP56726 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SmoP56726 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SmoP56726 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SmoP56726 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SmoP56726 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SmoP56726 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SmoP56726 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SmoP56726 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SmoP56726 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SmoP56726 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SmoP56726 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SmoP56726 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SmoP56726 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SmoP56726 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SmoP56726 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SmoP56726 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SmoP56726 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SmoP56726 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SmoP56726 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SmoP56726 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SmoP56726 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SmoP56726 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SmoP56726 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SmoP56726 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SmoP56726 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SmoP56726 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SmoP56726 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SmoP56726 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SmoP56726 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SmoP56726 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SmoP56726 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SmoP56726 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SmoP56726 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SmoP56726 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SmoP56726 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SmoP56726 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SmoP56726 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SmoP56726 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SmoP56726 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SmoP56726 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SmoP56726 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SmoP56726 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SmoP56726 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SmoP56726 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SmoP56726 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SmoP56726 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SmoP56726 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SmoP56726 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SmoP56726 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SmoP56726 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SmoP56726 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SmoP56726 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SmoP56726 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SmoP56726 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SmoP56726 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SmoP56726 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SmoP56726 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SmoP56726 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SmoP56726 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SmoP56726 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SmoP56726 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SmoP56726 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
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