Protein–RNA interactions for Protein: P54279

Pms2, Mismatch repair endonuclease PMS2, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pms2P54279 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pms2P54279 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pms2P54279 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pms2P54279 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pms2P54279 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pms2P54279 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pms2P54279 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pms2P54279 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pms2P54279 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pms2P54279 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pms2P54279 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms