Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cux1P53564 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cux1P53564 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cux1P53564 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cux1P53564 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux1P53564 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux1P53564 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cux1P53564 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cux1P53564 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cux1P53564 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms