Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp1P52624 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp1P52624 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp1P52624 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms