Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms