Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TspoP50637 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TspoP50637 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TspoP50637 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TspoP50637 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TspoP50637 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TspoP50637 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TspoP50637 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TspoP50637 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
TspoP50637 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TspoP50637 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TspoP50637 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TspoP50637 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TspoP50637 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TspoP50637 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
TspoP50637 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TspoP50637 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TspoP50637 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TspoP50637 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TspoP50637 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TspoP50637 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TspoP50637 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TspoP50637 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TspoP50637 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TspoP50637 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TspoP50637 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TspoP50637 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TspoP50637 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TspoP50637 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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TspoP50637 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TspoP50637 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
TspoP50637 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TspoP50637 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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TspoP50637 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TspoP50637 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TspoP50637 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TspoP50637 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
TspoP50637 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TspoP50637 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TspoP50637 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TspoP50637 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TspoP50637 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TspoP50637 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TspoP50637 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TspoP50637 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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TspoP50637 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TspoP50637 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TspoP50637 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TspoP50637 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TspoP50637 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TspoP50637 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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TspoP50637 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TspoP50637 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TspoP50637 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TspoP50637 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TspoP50637 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TspoP50637 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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TspoP50637 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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TspoP50637 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TspoP50637 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TspoP50637 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TspoP50637 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TspoP50637 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TspoP50637 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TspoP50637 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TspoP50637 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TspoP50637 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TspoP50637 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TspoP50637 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TspoP50637 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TspoP50637 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TspoP50637 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TspoP50637 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TspoP50637 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TspoP50637 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TspoP50637 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TspoP50637 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TspoP50637 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TspoP50637 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TspoP50637 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TspoP50637 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TspoP50637 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TspoP50637 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TspoP50637 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TspoP50637 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TspoP50637 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TspoP50637 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TspoP50637 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
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