Protein–RNA interactions for Protein: P50446

Krt6a, Keratin, type II cytoskeletal 6A, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6aP50446 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt6aP50446 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms