Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms