Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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