Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Tmod1P49813 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Tmod1P49813 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Tmod1P49813 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Tmod1P49813 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Tmod1P49813 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
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Tmod1P49813 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Tmod1P49813 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Tmod1P49813 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tmod1P49813 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
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Tmod1P49813 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Tmod1P49813 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Tmod1P49813 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
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Tmod1P49813 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Tmod1P49813 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms