Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd1P48410 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd1P48410 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms