Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf2P39429 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf2P39429 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf2P39429 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf2P39429 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf2P39429 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf2P39429 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf2P39429 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf2P39429 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms