Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf1P39428 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf1P39428 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf1P39428 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf1P39428 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf1P39428 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf1P39428 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms