Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ly6dP35459 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms