Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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