Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RxraP28700 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RxraP28700 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RxraP28700 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RxraP28700 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RxraP28700 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RxraP28700 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RxraP28700 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RxraP28700 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RxraP28700 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RxraP28700 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RxraP28700 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RxraP28700 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RxraP28700 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RxraP28700 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RxraP28700 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RxraP28700 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RxraP28700 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RxraP28700 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RxraP28700 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RxraP28700 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RxraP28700 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RxraP28700 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RxraP28700 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RxraP28700 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RxraP28700 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RxraP28700 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RxraP28700 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RxraP28700 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RxraP28700 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RxraP28700 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RxraP28700 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RxraP28700 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RxraP28700 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RxraP28700 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RxraP28700 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RxraP28700 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RxraP28700 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RxraP28700 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RxraP28700 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
RxraP28700 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RxraP28700 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RxraP28700 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RxraP28700 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RxraP28700 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RxraP28700 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RxraP28700 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RxraP28700 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RxraP28700 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RxraP28700 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RxraP28700 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RxraP28700 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RxraP28700 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RxraP28700 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RxraP28700 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RxraP28700 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RxraP28700 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RxraP28700 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RxraP28700 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RxraP28700 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RxraP28700 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RxraP28700 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RxraP28700 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RxraP28700 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RxraP28700 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RxraP28700 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RxraP28700 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RxraP28700 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RxraP28700 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RxraP28700 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RxraP28700 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RxraP28700 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RxraP28700 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RxraP28700 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RxraP28700 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RxraP28700 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RxraP28700 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RxraP28700 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RxraP28700 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RxraP28700 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RxraP28700 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RxraP28700 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RxraP28700 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RxraP28700 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RxraP28700 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RxraP28700 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RxraP28700 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RxraP28700 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RxraP28700 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RxraP28700 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RxraP28700 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RxraP28700 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RxraP28700 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RxraP28700 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RxraP28700 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RxraP28700 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RxraP28700 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RxraP28700 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RxraP28700 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RxraP28700 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms