Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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PdgfraP26618 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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PdgfraP26618 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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PdgfraP26618 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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PdgfraP26618 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PdgfraP26618 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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