Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RdxP26043 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RdxP26043 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RdxP26043 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RdxP26043 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RdxP26043 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RdxP26043 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RdxP26043 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RdxP26043 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RdxP26043 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RdxP26043 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RdxP26043 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RdxP26043 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RdxP26043 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RdxP26043 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RdxP26043 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RdxP26043 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RdxP26043 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RdxP26043 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RdxP26043 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RdxP26043 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RdxP26043 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RdxP26043 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RdxP26043 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RdxP26043 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RdxP26043 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RdxP26043 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RdxP26043 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RdxP26043 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RdxP26043 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RdxP26043 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RdxP26043 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RdxP26043 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RdxP26043 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RdxP26043 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RdxP26043 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RdxP26043 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RdxP26043 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RdxP26043 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RdxP26043 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RdxP26043 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RdxP26043 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RdxP26043 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RdxP26043 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RdxP26043 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RdxP26043 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RdxP26043 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RdxP26043 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RdxP26043 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RdxP26043 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RdxP26043 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RdxP26043 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RdxP26043 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RdxP26043 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RdxP26043 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RdxP26043 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RdxP26043 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RdxP26043 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RdxP26043 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RdxP26043 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RdxP26043 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RdxP26043 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RdxP26043 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RdxP26043 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RdxP26043 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RdxP26043 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RdxP26043 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RdxP26043 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RdxP26043 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RdxP26043 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RdxP26043 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RdxP26043 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RdxP26043 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RdxP26043 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RdxP26043 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RdxP26043 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RdxP26043 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RdxP26043 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RdxP26043 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RdxP26043 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RdxP26043 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RdxP26043 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RdxP26043 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RdxP26043 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RdxP26043 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RdxP26043 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RdxP26043 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RdxP26043 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RdxP26043 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RdxP26043 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RdxP26043 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RdxP26043 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RdxP26043 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RdxP26043 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RdxP26043 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RdxP26043 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RdxP26043 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RdxP26043 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RdxP26043 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RdxP26043 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms