Protein–RNA interactions for Protein: P24549

Aldh1a1, Retinal dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a1P24549 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aldh1a1P24549 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a1P24549 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms