Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd12P23812 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd12P23812 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd12P23812 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd12P23812 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd12P23812 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd12P23812 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd12P23812 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd12P23812 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd12P23812 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd12P23812 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd12P23812 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd12P23812 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd12P23812 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd12P23812 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd12P23812 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd12P23812 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd12P23812 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd12P23812 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd12P23812 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd12P23812 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd12P23812 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd12P23812 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd12P23812 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd12P23812 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd12P23812 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd12P23812 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd12P23812 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxd12P23812 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxd12P23812 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxd12P23812 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxd12P23812 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd12P23812 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd12P23812 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd12P23812 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd12P23812 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms