Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RarbP22605 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RarbP22605 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RarbP22605 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RarbP22605 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RarbP22605 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RarbP22605 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RarbP22605 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RarbP22605 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RarbP22605 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RarbP22605 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RarbP22605 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RarbP22605 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RarbP22605 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RarbP22605 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RarbP22605 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RarbP22605 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RarbP22605 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RarbP22605 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RarbP22605 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RarbP22605 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RarbP22605 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RarbP22605 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RarbP22605 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RarbP22605 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RarbP22605 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RarbP22605 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RarbP22605 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RarbP22605 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RarbP22605 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RarbP22605 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RarbP22605 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RarbP22605 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RarbP22605 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RarbP22605 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RarbP22605 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RarbP22605 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RarbP22605 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RarbP22605 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RarbP22605 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RarbP22605 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RarbP22605 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RarbP22605 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RarbP22605 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RarbP22605 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RarbP22605 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RarbP22605 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RarbP22605 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RarbP22605 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RarbP22605 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RarbP22605 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RarbP22605 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RarbP22605 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RarbP22605 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RarbP22605 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RarbP22605 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RarbP22605 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RarbP22605 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RarbP22605 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RarbP22605 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RarbP22605 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RarbP22605 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RarbP22605 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RarbP22605 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RarbP22605 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RarbP22605 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RarbP22605 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RarbP22605 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RarbP22605 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RarbP22605 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RarbP22605 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RarbP22605 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RarbP22605 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RarbP22605 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RarbP22605 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RarbP22605 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RarbP22605 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RarbP22605 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RarbP22605 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RarbP22605 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RarbP22605 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RarbP22605 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RarbP22605 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RarbP22605 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RarbP22605 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RarbP22605 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RarbP22605 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RarbP22605 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RarbP22605 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RarbP22605 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RarbP22605 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RarbP22605 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RarbP22605 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RarbP22605 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RarbP22605 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RarbP22605 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RarbP22605 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RarbP22605 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RarbP22605 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RarbP22605 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms