Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms