Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P20040 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P20040 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P20040 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P20040 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P20040 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
P20040 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P20040 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P20040 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P20040 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P20040 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P20040 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P20040 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P20040 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P20040 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
P20040 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P20040 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P20040 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P20040 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P20040 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P20040 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P20040 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P20040 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P20040 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P20040 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P20040 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P20040 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P20040 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P20040 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P20040 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P20040 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
P20040 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
P20040 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P20040 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P20040 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P20040 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P20040 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P20040 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P20040 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P20040 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P20040 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P20040 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P20040 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P20040 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
P20040 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P20040 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P20040 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P20040 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
P20040 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
P20040 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
P20040 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
P20040 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
P20040 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P20040 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P20040 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
P20040 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
P20040 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P20040 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
P20040 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
P20040 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P20040 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
P20040 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
P20040 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
P20040 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
P20040 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
P20040 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
P20040 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P20040 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P20040 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
P20040 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P20040 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P20040 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
P20040 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
P20040 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P20040 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P20040 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P20040 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P20040 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P20040 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P20040 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P20040 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P20040 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P20040 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P20040 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P20040 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P20040 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P20040 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P20040 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P20040 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P20040 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P20040 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
P20040 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P20040 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
P20040 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P20040 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P20040 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P20040 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P20040 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P20040 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P20040 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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