Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a1P19437 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a1P19437 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a1P19437 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a1P19437 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a1P19437 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a1P19437 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a1P19437 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a1P19437 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a1P19437 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a1P19437 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a1P19437 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a1P19437 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a1P19437 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a1P19437 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a1P19437 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a1P19437 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a1P19437 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a1P19437 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a1P19437 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a1P19437 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a1P19437 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a1P19437 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a1P19437 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a1P19437 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a1P19437 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a1P19437 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a1P19437 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a1P19437 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a1P19437 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a1P19437 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a1P19437 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a1P19437 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a1P19437 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a1P19437 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a1P19437 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms