Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms