Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpraP18052 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PtpraP18052 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtpraP18052 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtpraP18052 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtpraP18052 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtpraP18052 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtpraP18052 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtpraP18052 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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