Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PcnaP17918 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PcnaP17918 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PcnaP17918 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PcnaP17918 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PcnaP17918 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PcnaP17918 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PcnaP17918 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PcnaP17918 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PcnaP17918 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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