Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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