Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ass1P16460 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ass1P16460 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ass1P16460 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ass1P16460 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ass1P16460 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ass1P16460 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ass1P16460 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ass1P16460 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ass1P16460 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ass1P16460 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 457.3 ms