Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Gm38247-201ENSMUST00000194675 433 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Hprt-201ENSMUST00000026723 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms