Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms