Protein–RNA interactions for Protein: P05531

Xlr, X-linked lymphocyte-regulated protein PM1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XlrP05531 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
XlrP05531 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XlrP05531 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XlrP05531 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XlrP05531 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
XlrP05531 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
XlrP05531 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
XlrP05531 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XlrP05531 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XlrP05531 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XlrP05531 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XlrP05531 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
XlrP05531 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XlrP05531 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
XlrP05531 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XlrP05531 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
XlrP05531 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XlrP05531 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16■□□□□ 0.15
XlrP05531 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XlrP05531 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
XlrP05531 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XlrP05531 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
XlrP05531 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16■□□□□ 0.15
XlrP05531 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XlrP05531 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
XlrP05531 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XlrP05531 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XlrP05531 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XlrP05531 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
XlrP05531 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XlrP05531 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XlrP05531 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XlrP05531 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XlrP05531 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XlrP05531 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
XlrP05531 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XlrP05531 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XlrP05531 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XlrP05531 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
XlrP05531 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XlrP05531 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
XlrP05531 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XlrP05531 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XlrP05531 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XlrP05531 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XlrP05531 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XlrP05531 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XlrP05531 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XlrP05531 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XlrP05531 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XlrP05531 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XlrP05531 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XlrP05531 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XlrP05531 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XlrP05531 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XlrP05531 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XlrP05531 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XlrP05531 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XlrP05531 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XlrP05531 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XlrP05531 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XlrP05531 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XlrP05531 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XlrP05531 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
XlrP05531 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XlrP05531 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XlrP05531 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XlrP05531 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XlrP05531 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XlrP05531 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XlrP05531 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XlrP05531 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XlrP05531 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XlrP05531 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XlrP05531 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XlrP05531 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XlrP05531 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XlrP05531 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XlrP05531 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XlrP05531 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XlrP05531 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XlrP05531 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XlrP05531 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XlrP05531 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XlrP05531 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XlrP05531 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XlrP05531 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XlrP05531 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XlrP05531 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
XlrP05531 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XlrP05531 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XlrP05531 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XlrP05531 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XlrP05531 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XlrP05531 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XlrP05531 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XlrP05531 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XlrP05531 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XlrP05531 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XlrP05531 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms