Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
JtbO88824 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
JtbO88824 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
JtbO88824 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
JtbO88824 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
JtbO88824 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
JtbO88824 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
JtbO88824 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
JtbO88824 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
JtbO88824 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
JtbO88824 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
JtbO88824 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
JtbO88824 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
JtbO88824 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
JtbO88824 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
JtbO88824 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
JtbO88824 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
JtbO88824 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
JtbO88824 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
JtbO88824 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
JtbO88824 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
JtbO88824 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
JtbO88824 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
JtbO88824 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
JtbO88824 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
JtbO88824 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
JtbO88824 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
JtbO88824 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
JtbO88824 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
JtbO88824 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
JtbO88824 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
JtbO88824 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
JtbO88824 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
JtbO88824 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
JtbO88824 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
JtbO88824 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
JtbO88824 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
JtbO88824 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
JtbO88824 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
JtbO88824 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
JtbO88824 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
JtbO88824 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
JtbO88824 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
JtbO88824 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
JtbO88824 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
JtbO88824 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
JtbO88824 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
JtbO88824 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
JtbO88824 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
JtbO88824 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
JtbO88824 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
JtbO88824 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
JtbO88824 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
JtbO88824 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
JtbO88824 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
JtbO88824 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
JtbO88824 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
JtbO88824 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
JtbO88824 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
JtbO88824 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
JtbO88824 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
JtbO88824 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
JtbO88824 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
JtbO88824 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
JtbO88824 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
JtbO88824 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
JtbO88824 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
JtbO88824 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
JtbO88824 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
JtbO88824 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
JtbO88824 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
JtbO88824 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
JtbO88824 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
JtbO88824 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
JtbO88824 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
JtbO88824 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
JtbO88824 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
JtbO88824 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
JtbO88824 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
JtbO88824 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
JtbO88824 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
JtbO88824 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
JtbO88824 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
JtbO88824 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
JtbO88824 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
JtbO88824 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
JtbO88824 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
JtbO88824 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
JtbO88824 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
JtbO88824 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
JtbO88824 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
JtbO88824 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
JtbO88824 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
JtbO88824 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
JtbO88824 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
JtbO88824 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
JtbO88824 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
JtbO88824 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
JtbO88824 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
JtbO88824 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms