Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Dnmt3bO88509 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Dnmt3bO88509 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Dnmt3bO88509 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Dnmt3bO88509 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Dnmt3bO88509 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Dnmt3bO88509 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Dnmt3bO88509 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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