Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CntfrO88507 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CntfrO88507 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CntfrO88507 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CntfrO88507 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
CntfrO88507 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
CntfrO88507 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms