Protein–RNA interactions for Protein: O88447

Klc1, Kinesin light chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc1O88447 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klc1O88447 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc1O88447 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc1O88447 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc1O88447 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc1O88447 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc1O88447 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc1O88447 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc1O88447 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc1O88447 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc1O88447 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc1O88447 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc1O88447 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc1O88447 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc1O88447 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc1O88447 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc1O88447 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc1O88447 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc1O88447 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc1O88447 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc1O88447 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc1O88447 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc1O88447 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc1O88447 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc1O88447 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc1O88447 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc1O88447 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc1O88447 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc1O88447 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc1O88447 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc1O88447 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc1O88447 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc1O88447 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc1O88447 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc1O88447 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc1O88447 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc1O88447 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc1O88447 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc1O88447 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc1O88447 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc1O88447 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc1O88447 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc1O88447 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc1O88447 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc1O88447 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc1O88447 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc1O88447 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc1O88447 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc1O88447 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc1O88447 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc1O88447 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc1O88447 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc1O88447 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc1O88447 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc1O88447 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc1O88447 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klc1O88447 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klc1O88447 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klc1O88447 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klc1O88447 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klc1O88447 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klc1O88447 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klc1O88447 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Klc1O88447 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Klc1O88447 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Klc1O88447 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klc1O88447 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klc1O88447 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Klc1O88447 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klc1O88447 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klc1O88447 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klc1O88447 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klc1O88447 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klc1O88447 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klc1O88447 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Klc1O88447 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Klc1O88447 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Klc1O88447 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klc1O88447 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klc1O88447 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klc1O88447 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klc1O88447 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Klc1O88447 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klc1O88447 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Klc1O88447 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klc1O88447 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Klc1O88447 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klc1O88447 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klc1O88447 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Klc1O88447 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klc1O88447 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klc1O88447 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Klc1O88447 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klc1O88447 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klc1O88447 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klc1O88447 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klc1O88447 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klc1O88447 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klc1O88447 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klc1O88447 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms